Com sede em Rio Branco - Acre, a FIEAC é formada por um sistema diretivo: Conselho de Representantes, Diretoria e Conselho Fiscal.

Eleita pelo Conselho de Representantes e formada por membros que o compõem, a Diretoria da CNI, além do Presidente, é integrada por um 1º Vice-Presidente, seis Vice-Presidentes, dois Diretores-Secretários, dois Diretores-Tesoureiros e seis Diretores-Suplentes.

A diretoria é renovada a cada quatro anos, sendo que o presidente só pode exercer dois mandatos consecutivos. O Presidente da FIEAC acumula as funções de Presidente do Conselho do SENAI-DR/AC e do Conselho Superior do IEL-NR/AC, e de Diretor Regional do SESI-DR/AC.

O Conselho de Representantes é o órgão máximo da FIEAC, sendo composto por delegados representantes dos 10 sindicatos filiados: SINCEPAV, SINCON, SINDIGRAF, SINDMINERAL, SINDMÓVEIS, SINDOAC, SINDPAN, SINDUSCON, SINDUSMAD e SINPAL.